全国の大学薬学部および薬科大学は、国立・公立・私立を合わせて現在78校ほど設置されています。
大きく分けると、研究重視の4年制学科（薬科学科など）と、薬剤師国家試験の受験資格が得られる6年制学科（薬学科）があります。
以下に主な大学を分類別でまとめました。
国立大学（14校）
旧帝国大学をはじめとする難関校が多く、高度な研究環境が整っています。
北海道大学
東北大学
千葉大学：国公立の中でもトップクラスの偏差値を誇ります。
東京大学
富山大学
金沢大学
名古屋大学
京都大学
大阪大学
岡山大学
広島大学
徳島大学
九州大学
長崎大学
公立大学（5校）
地域医療への貢献や、比較的安価な学費が特徴です。
岐阜薬科大学
静岡県立大学
名古屋市立大学
山陽小野田市立山口東京理科大学
和歌山県立医科大学
私立大学（約60校）
伝統のある「薬科大学」単科校から、総合大学の薬学部まで多様です。
伝統校・難関校
慶應義塾大学
東京理科大学
北里大学：高い国家試験合格率を維持しています。
立命館大学
近畿大学：合格者数・合格率ともに全国トップクラスの実績があります。
東京4薬大（歴史ある単科大学）
東京薬科大学
星薬科大学
明治薬科大学
昭和薬科大学
関西三薬（関西の伝統校）
京都薬科大学
大阪医科薬科大学
神戸薬科大学
なお、九州、四国、北海道、沖縄の主な私立薬科大学・薬学部は以下の通りです。
北海道: 北海道科学大学、北海道医療大学
四国: 徳島文理大学、松山大学
九州: 福岡大学、福岡薬科大学、崇城大学、九州医療科学大学、長崎国際大学
沖縄: （私立の薬学部は設置されていません）
主な私立大学の特徴（一部）
福岡大学: 九州地区の私立薬学で歴史がある。
徳島文理大学: 香川・徳島にキャンパスを持つ総合大学。
北海道医療大学: 北海道内の私立で薬学教育に強み。
九州医療科学大学: 宮崎県に位置し、国家試験合格率も高い。
